Eğitim Bilgileri
2007 - 2011
2007 - 2011Doktora
University College Dublin, Conway Institute, İrlanda
Yaptığı Tezler
2011
2011Doktora
Using C. Elegans to Investigate Ciliary Protein Tronsport Into Cilia
University College Dublin, Conway Institute, School Of Biomolecular & Biomed Science
Yabancı Diller
C1 İleri
C1 İleriİngilizce
Araştırma Alanları
Sağlık Bilimleri
Tıp
Temel Tıp Bilimleri
Tıbbi Biyoloji
Akademik Unvanlar / Görevler
2018 - Devam Ediyor
2018 - Devam EdiyorDr.Öğr.Üyesi
Abdullah Gül Üniversitesi, Yaşam Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü
2017 - 2018
2017 - 2018Yrd.Doç.Dr.
Abdullah Gül Üniversitesi, Yaşam Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü
Verdiği Dersler
Tasarladığı Dersler
Lisans
Lisans
Genetiğin Temelleri
Kaplan O. İ.
Genetik
Kaplan O. İ.
BioEngineering Lab I
Ortakcı F., İşoğlu İ. A., Kaplan O. İ.
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2023
2023Matching variants for functional characterization of genetic variants
ÇEVİK KAPLAN S., Zhao P., Zorluer A., Pir M. S., Bian W., KAPLAN O. İ.
G3: Genes, Genomes, Genetics , cilt.13, sa.12, 2023 (SCI-Expanded)
2023
2023CiliaMiner: an integrated database for ciliopathy genes and ciliopathies
Turan M. G., Orhan M. E., ÇEVİK KAPLAN S., KAPLAN O. İ.
Database : the journal of biological databases and curation , cilt.2023, 2023 (SCI-Expanded)
2023
2023WDR31 displays functional redundancy with GTPase-activating proteins (GAPs) ELMOD and RP2 in regulating IFT complex and recruiting the BBSome to cilium.
Cevik S., Peng X., Beyer T., Pir M. S., Yenisert F., Woerz F., et al.
Life science alliance , cilt.6, sa.8, 2023 (SCI-Expanded)
2023
2023RPI-1 (human DCDC2) displays functional redundancy with Nephronophthisis 4 in regulating cilia biogenesis in C. elegans
Kaplan O. I.
Turkish Journal of Biology , cilt.47, sa.1, ss.74-83, 2023 (SCI-Expanded)
2022
2022ConVarT: a new search engine for orthologous variants for functional inference of human genetic variants
Pir M. S., Bilgin H. I., Sayici A., Coskun F., Torun F. M., Zhao P., et al.
EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS , cilt.30, sa.SUPPL 1, ss.504-505, 2022 (SCI-Expanded)
2022
2022ConVarT: a search engine for matching human genetic variants with variants from non-human species.
Pir M. S., Bilgin H. I., Sayici A., Coşkun F., Torun F. M., Zhao P., et al.
Nucleic acids research , cilt.50, 2022 (SCI-Expanded)
2018
2018Environmental responsiveness of tubulin glutamylation in sensory cilia is regulated by the p38 MAPK pathway
Kimura Y., Tsutsumi K., Konno A., Ikegami K., Hameed S., Kaneko T., et al.
SCIENTIFIC REPORTS , cilt.8, 2018 (SCI-Expanded)
2016
2016G-quadruplex prediction in E. coli genome reveals a conserved putative G-quadruplex-Hairpin-Duplex switch
KAPLAN O. İ., Berber B., Hekim N., Doluca O.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH , cilt.44, sa.19, ss.9083-9095, 2016 (SCI-Expanded)
2013
2013Active Transport and Diffusion Barriers Restrict Joubert Syndrome-Associated ARL13B/ARL-13 to an Inv-like Ciliary Membrane Subdomain
ÇEVİK KAPLAN S., Sanders A. A. W. M., Van Wijk E., Boldt K., Clarke L., van Reeuwijk J., et al.
PLOS GENETICS , cilt.9, sa.12, 2013 (SCI-Expanded)
2012
2012Endocytosis Genes Facilitate Protein and Membrane Transport in C. elegans Sensory Cilia
KAPLAN O. İ., Doroquez D. B., ÇEVİK KAPLAN S., Bowie R. V., Clarke L., Sanders A. A. W. M., et al.
CURRENT BIOLOGY , cilt.22, sa.6, ss.451-460, 2012 (SCI-Expanded)
2010
2010The AP-1 clathrin adaptor facilitates cilium formation and functions with RAB-8 in C. elegans ciliary membrane transport
Kaplan O. İ., MOLLA-HERMAN A., Cevik S., GHOSSOUB R., Kida K., KIMURA Y., et al.
JOURNAL OF CELL SCIENCE , cilt.123, sa.22, ss.3966-3977, 2010 (SCI-Expanded)
2010
2010Identification of Tubulin Deglutamylase among Caenorhabditis elegans and Mammalian Cytosolic Carboxypeptidases (CCPs)
Kimura Y., Kurabe N., Ikegami K., Tsutsumi K., Konishi Y., KAPLAN O. İ., et al.
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY , cilt.285, sa.30, ss.22934-22939, 2010 (SCI-Expanded)
2010
2010Joubert syndrome Arl13b functions at ciliary membranes and stabilizes protein transport in Caenorhabditis elegans
ÇEVİK KAPLAN S., Hori Y., KAPLAN O. İ., Kida K., Toivenon T., Foley-Fisher C., et al.
JOURNAL OF CELL BIOLOGY , cilt.188, sa.6, ss.953-969, 2010 (SCI-Expanded)
2008
2008Intraflagellar transport: from molecular characterisation to mechanism
Blacque O. E., ÇEVİK KAPLAN S., KAPLAN O. İ.
FRONTIERS IN BIOSCIENCE-LANDMARK , cilt.13, ss.2633-2652, 2008 (SCI-Expanded)
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2024
2024Investigating the Impact of Birt–Hogg–Dubé Syndrome Associated Folliculin (FLCN) and Retinitis Pigmentosa 2 (RP2) Loss on Cilia Function and Morphology
Kaplan O. I.
Cumhuriyet Science Journal , cilt.45, sa.2, ss.235-239, 2024 (Hakemli Dergi)
2022
2022ConVarT: Search Engine for Missense Variants Between Humans and Other Organisms.
Pir M. S., Cevik S., KAPLAN O. İ.
Current protocols , cilt.2, sa.11, 2022 (Hakemli Dergi)
2022
2022Protocol for determining the average speed and frequency of kinesin and dynein-driven intraflagellar transport (IFT) in C. elegans.
Turan M. G., Kantarci H., Temtek S. D., Cakici O., Cevik S., KAPLAN O. İ.
STAR protocols , cilt.3, sa.3, ss.101498, 2022 (Hakemli Dergi)
2021
2021The Joubert syndrome protein CEP41 is excluded from the distal segment of cilia in <i>C. elegans</i>.
Cevik S., Kaplan O. İ.
microPublication biology , cilt.2021, sa.17912, 2021 (Hakemli Dergi)
2021
2021Subcellular localization of the voltage-gated K+ channel EGL-36 , a member of the KV3 subfamily, in the ciliated sensory neurons in <i>C. elegans</i>.
Cevik S., Kaplan O. İ.
microPublication biology , cilt.2021, 2021 (Hakemli Dergi)
2021
2021MSABrowser: dynamic and fast visualization of sequence alignments, variations and annotations
Kaplan O. İ.
Bioinformatics Advances , cilt.1, sa.", ss.1-4, 2021 (Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2018
2018CRISPR Teknikleri ve Biyoteknoloji Alanında Uygulamaları
KAPLAN O. İ., BERBER B., Aydin C., Tastan C., YILANCIOĞLU K.
Uluslara İVEK Bio Kongresi, 26 - 28 Kasım 2018
2018
2018CRISPR Teknolojileri ve Uygulamaları
KAPLAN O. İ.
V. Uluslararası Katılımlı Deneysel Hematoloji Kongresi, 27 - 29 Nisan 2018
2017
2017The characterizationof ARMC9, a Recently Identified Joubert Syndrome Gene, in Cilia Biogenesis
Artan E., Çiçek E., KAPLAN O. İ., ÇEVİK KAPLAN S.
InternationalMolecular Biology Congress, 8 - 10 Eylül 2017
2017
2017Functionalcharacterization of novel ciliary genes in C. elegans
Yenisert F., Ateş B., ÇEVİK KAPLAN S., KAPLAN O. İ.
International Molecular Biology Congress, 8 - 10 Eylül 2017
2017
2017Hunt For Novel GenesAssociated With Cilia Biogenesis/Ciliopathy
ÇEVİK KAPLAN S., Çiçek E., Gümüştop İ., KAPLAN O. İ.
Innovation In Medicine Meetings 3, 11 - 13 Mayıs 2017
2015
2015Uncovering Molecular Barriers to Direct Cell Reprogramming in C elegans
KAPLAN O. İ.
20 th International C. elegans Meeting, 24 - 28 Haziran 2015
2014
2014A forward genetic screen for factors that limit conversion of somatic and germ cells into a Glutamatergic neuron like cell in C elegans
KAPLAN O. İ.
European C. elegans Meeting, Berlin, Almanya, 15 - 17 Mayıs 2014
Desteklenen Projeler
2018 - Devam Ediyor
2018 - Devam EdiyorBiyoinformatik Yoluyla Elde Edilen Aday Silya Genlerinin Fonksiyonlarının Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
KAPLAN O. İ. (Yürütücü)
2022 - 2024
2022 - 2024PATL1 Geninin Meyve Sineği ve C. Elegans Modellerinde Hastalık Geni Olarak Doğrulanması ve Nöronlardaki Etkileşim Partnerlerinin BioID Yöntemiyle Tanımlanması
TÜBİTAK Projesi
Kaplan O. İ., Çelik Fuss A.(Yürütücü)
2018 - 2022
2018 - 2022Functional Characterization of Joubert Syndrome Associated CEP41; C. elegans mutant generated by CRISPR
TÜBİTAK Projesi
Kaplan O. I.
2018 - 2021
2018 - 2021Yeni Silya Genlerinin Ortaya Çıkarılması ve Karakterize Edilmesi Proje YürütücüsüAK
TÜBİTAK Projesi
Kaplan O. I.
Bilimsel Yayınlarda Hakemlikler
Temmuz 2022
Temmuz 2022NATURE COMMUNICATIONS
SCI Kapsamındaki Dergi
Haziran 2022
Haziran 2022