FBN1 Hedefleyen miRNA'ların Kapsamlı Tahmini: Marfan Sendromu için Sistem Biyolojisi Yaklaşımı


ORHAN M. E., Demirci Y. M., Demirci M. D. S.

Gazi Medical Journal, cilt.36, sa.4, ss.401-406, 2025 (ESCI) identifier identifier

  • Yayın Türü: Makale / Tam Makale
  • Cilt numarası: 36 Sayı: 4
  • Basım Tarihi: 2025
  • Doi Numarası: 10.12996/gmj.2025.4444
  • Dergi Adı: Gazi Medical Journal
  • Derginin Tarandığı İndeksler: Emerging Sources Citation Index (ESCI), Scopus, Academic Search Premier, TR DİZİN (ULAKBİM)
  • Sayfa Sayıları: ss.401-406
  • Abdullah Gül Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Amaç: Marfan sendromu (MFS), genellikle FBN1 genindeki mutasyonlardan kaynaklanan genetik bir bağ dokusu bozukluğudur. Son yıllarda, gen ekspresyonunu post-transkripsiyonel düzeyde düzenleyen mikroRNA’ların (miRNA’lar) bu hastalıktaki rolü ön plana çıkmaktadır. Bu çalışmanın amacı, FBN1 transkriptini hedef alan miRNA’ları sistematik olarak tanımlamak ve potansiyel düzenleyici etkileşimleri ortaya çıkarmaktır. Yöntemler: İnsan miRNA dizileri miRBase (Sürüm 22.1) veri tabanından alınmış ve FBN1 geninin referans transkripti (RefSeq: NM_000138.5) Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi üzerinden elde edilmiştir. psRNATarget sunucusu kullanılarak FBN1 ile etkileşime giren miRNA’lar tahmin edilmiştir. En güçlü etkileşime sahip aday miRNA’ların ekspresyon düzeyleri ve hastalıklarla ilişkileri veri tabanları ve literatür taramaları ile değerlendirilmiştir. Bulgular: Toplamda 2656 insan miRNA’sı analiz edilmiş ve bunlardan 251’inin FBN1 transkripti ile potansiyel bağlanma bölgeleri olduğu öngörülmüştür. Özellikle hsa-miR-181 ailesi çok sayıda bağlanma bölgesiyle dikkat çekmiştir. Literatür bulguları, bu miRNA ailesinin MFS hastalarında aşağı düzenlendiğini göstermektedir. Sonuç: Bu çalışma, hsa-miR-181 ailesinin FBN1 üzerindeki düzenleyici etkisini ortaya koyarak MFS’ndaki potansiyel moleküler mekanizmalara ışık tutmaktadır. Elde edilen bulgular, RNA temelli tedavi yaklaşımları için yeni hedeflerin geliştirilmesinde kullanılabilir.
Objective: Marfan syndrome (MFS) is a genetic connective tissue disorder primarily caused by mutations in the FBN1 gene. Emerging evidence highlights the regulatory role of microRNAs (miRNAs) in modulating gene expression in MFS, but a systematic investigation into miRNAs targeting FBN1 is lacking. This study aimed to comprehensively identify miRNAs interacting with the FBN1 transcript to reveal potential molecular regulators and therapeutic targets. Methods: Human miRNA sequences were retrieved from miRBase (Release 22.1), and the canonical FBN1 transcript (RefSeq: NM_000138.5) was used for target prediction. Computational interaction analysis was conducted using the psRNATarget server with stringent parameters to detect potential miRNA binding sites. Expression profiles and disease associations of the top candidate miRNAs were further investigated through database integration and literature review. Results: Out of 2656 human mature miRNAs analyzed, 251 were predicted to bind FBN1, with the hsa-miR-181 family exhibiting the highest number of predicted interactions. Evidence from the literature highlighted dysregulation of hsa-miR-181 expression in MFS patients, suggesting a functional role in disease pathophysiology. Conclusion: This study identifies key members of the hsa-miR-181 family as post-transcriptional regulators of FBN1, offering new insights into miRNA-driven mechanisms in MFS. These findings support the potential of RNA-based diagnostics and therapeutic strategies targeting miRNA-FBN1 interactions.