Akademik Veri Yönetim Sistemi
49th FEBS CONGRESS, İstanbul, Türkiye, 5 - 09 Temmuz 2025, ss.418, (Özet Bildiri)
Gri küfe neden olan Botrytis cinerea, geleneksel fungisitlere direnç geliştiren önemli bir fungal patojendir. Bu araştırma, rizosfer kökenli bir bakteri izolatı olan Serratia fonticola EBS19'un protein etkileşimi ve genomik özellikleri üzerinde durarak biyokontrol potansiyelini incelemektedir. Genom dizilimi ve açıklamaları, antifungal etki gösterme potansiyeline sahip glikozit hidrolaz ve diğer litik enzim kodlayan genleri tanımlamıştır. Patojenlerin baskılanmasını destekleyen moleküler etkileşimleri ortaya çıkarmak için, B. cinerea'nın ana stres düzenleyicisi BAG1'in bakterilerden elde edilen bir glikozit hidrolaz ile in siliko protein-protein kenetlenmesi (docking) gerçekleştirdik. Bu, yüksek afiniteli bir bağlanma arayüzü göstererek, stres yollarına doğrudan müdahale ederek mantarların inhibisyonu için bir yol önermektedir. Dahası, karbon kaynağı kullanım profili, bitkiyle ilişkili habitatlarda hem adaptasyonu hem de istikrarı artırabilen türe özgü metabolik özellikler göstermiştir. Bu biyoenformatik sonuçları, faydalı mikropların işlevsel genomları hakkında bilgi verir ve S. fonticola EBS19'u hem gelecekte rekombinant kullanım hem de hedefli antifungal biyolojik preparatların oluşturulması için potansiyel bir aday olarak tanımlar. *Yıldızla işaretli yazarlar çalışmaya eşit şekilde katkıda bulunmuştur.
Botrytis cinerea, which causes gray mold, is a key fungalpathogen that develops resistance to traditional fungicides. Thisresearch examines the biocontrol potential of a rhizosphere-derived bacterial isolate, Serratia fonticola EBS19, with anemphasis on its protein-interaction and genomic properties.Genome sequencing and annotation identified glycosidehydrolase and other lytic enzyme encoding genes which have thepotential to impart antifungal action. In order to revealmolecular interactions supporting suppression of pathogens, weperformed in silico protein–protein docking of B. cinerea’sprincipal stress regulator BAG1 with a glycoside hydrolase frombacteria. This showed a high-affinity binding interface, proposinga pathway for inhibition of fungi directly by intercession in stresspathways. Moreover, carbon source utilization profiling showedstrain-specific metabolic traits which can promote adaptability aswell as stability in plant-associated habitats. These bioinformaticsresults give information about the functional genomics of usefulmicrobes and identify S. fonticola EBS19 as a potential candidatefor future recombinant use as well as for the creation of targetedantifungal biopreparations. *The authors marked with anasterisk equally contributed to the work.